Режиссёрами картины стали два номинанта Оскара: Байрон Ховард и Рич Мур, а также Джаред Буш. На счету Ховарда два мультфильма — «Вольт» и «Запутанная история» о Рапунцель. Мур работал над сериями «Симпсонов», «Футурамы» и над полнометражным мультфильмом о герое компьютерной игры «Ральф».
Создатели мультфильма вдохновлялись современными западными городами, такими как Сан-Франциско, Нью-Йорк, Торонто и Париж. В них есть китайские, итальянские, греческие кварталы, так и в Зверополисе есть районы, где существуют определённые виды животных. Несмотря на то, что сам Зверополис является городом млекопитающих, он намекнул на то, что есть и другие города для других животных, таких, как для птиц и рептилий в мире.
В анимационном «Городе героев» (2014) в эпизоде полёта Бэймакса и Хиро можно увидеть постер «Зверополиса». На футляре телефона Хани Лемон из Города героев изображено главное действующее лицо «Зверополиса».
В Зверополисе проживает 64 различных вида животных, большинство из которых имеют «привычную» физиологию, но у некоторых на конечностях присутствует по несколько пальцев.
В процессе создания образов, художники стремились сделать обитателей «Зверополиса» максимально реалистичными. Поэтому, если приглядеться, можно увидеть, что у лисы мех тёмно-охряной у корней и рыжий у самых кончиков. А у медведя мех настолько белоснежный, что отражает свет. Подобные «мелочи» характерны для всех персонажей мультфильма — даже второстепенных.
Персонаж Ника Уайлда срисован с диснеевского Робина Гуда из одноимённого мультфильма, который тоже был лисом. Работая над образом мэра города — льва Леодора Златогрива — художники вдохновились внешностью Муфасы из мультфильма «Король лев». Мистер Биг — пародия на главных героев «Крёстного отца» и «Лица со шрамом».
Внешность помощника мэра Зверополиса — овечки по имени Барашкис — основана на героях старых мультфильмов «Сыграй мою музыку» и «Время мелодий». Для мисс Барашкис художники создали несколько нарядов, среди которых — твидовое платье, блейзер, оранжевое платье с узором и маленький колокольчик вместо бейджа.
Персонаж Питер Мусбридж зависит от каждого региона для версии мультфильма. В то время, как Мусбридж остается лосём в американской и канадской версии, он заменяется на ягуара в бразильской версии, тануки в японской версии, и коалу в Австралийской и Новозеландской версии.
«Зверополис» стал 55-ым полнометражным мультфильмов студии «Disney». Мультфильм является пятым для студии Дисней, в котором главные герои — это антропоморфные животные, и в котором нет людей. Предыдущими были «Робин Гуд», «Бэмби», «Король Лев» и «Цыплёнок Цыпа».