Работа над фильмом «Охота на императора» проводилась кинокомпанией «Пиманов и партнеры» и компанией Welcome Media при поддержке Фонда кино.
Режиссером и соавтором сценария картины стал Алексей Пиманов. Фильм стал последней работой для режиссера, автора сценария и продюсера Алексея Пиманова, чья жизнь оборвалась 23 апреля 2026 года.
Съемки проходили в Санкт-Петербурге, Москве и Подмосковье. Основными локациями стали Московский Кремль, старинные храмы, соборы и усадьбы.
В работе над массовыми сценами принимали участие около 200 человек и несколько десятков лошадей.