Работа над картиной началась в 2019 году с заявления, которое сделал продюсер Алекс Гарсия. Он сообщил, что компания Legendary Pictures намерена реализовать как можно больше проектов в рамках медиафраншизы MonsterVerse, пока они находятся на пике популярности. Тогда шла интенсивная подготовка к съемкам картины «Годзилла против Конга», которая была завершена в 2021 году. Из-за пандемии вируса COVID-19 первые зрители сумели посмотреть новинку лишь в 2022. Картина имела значительный кассовый успех (570 миллионов долларов в прокате при общих затратах в 330 миллионов), что привело к решению продолжать заниматься историей соперничества двух фантастических гигантских монстров.
Фильм «Годзилла и Конг: новая империя» стал пятой картиной о Годзилле, снятой исключительно силами американских кинематографистов.
Съемки начались 29 июля 2022 года в Голд-Косте.
Авторы проекта утверждают, что в случае успеха предстоящего фильма они продолжат развитие сюжетной линии.